Si le variant BA.2 (Omicron) est actuellement le plus répandu en France, une surveillance sera menée afin de déterminer si les autres formes du virus SARS-CoV-2 sont susceptibles d’être remplacées, en plus de l’immunité acquise jusqu’à aujourd’hui et en provoquant une énième vague de contaminations au Covid-19. Les candidats sont helas encore trois noms. Voici les variantes de la famille « X » : elles s’appellent XD, XE, XF ou encore XL.
Tous ont pour particularité d’être des “recombinants”. Des virus que piochent des segments de génome à différents variants en circulation. “Pour qu’ils apparaissent, il faut d’abord une double contamination. Puis, au sein d’une même cellule, le système de replication du virus par polymerase enters into action, passe d’un variant à l’autre, copy a bout de l’un, puis un bout de l’autre”, explained Samira Fafi-Kremer, head of the CHU de Strasbourg virology laboratory, auprès de L’Express.
La France surveille XD
XD, I detected it for the premiere fois en janvier, est toujours en cours d’évaluation par les autorités sanitaires françaises in raison de son profil plutôt inquiétant. “La majorité du génome du variant XD corresponds to its sous-lignage AY.4 (Delta), et une large portion du gène S (codant pour la protéine Spike) corresponds to its sous-lignage BA.1 (Omicron)”, livre la dernière Analyze the risks related to the variants carried out by Santé publique France, et datée du 23 mars. L’Organisation mondiale de la Santé (WHO) l’a également placé sous surveillance.
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Lors d’un récent point presse, Santé publique France racontait ainsi avoir I observed chez certains malades des symptômes plus proches de ceux ressentis à cause du variant Delta, comme la perte de goût, sans davantage de sévérité. On the other hand, “in terms of interaction with anticorps, the characteristics are more proches than Omicron do not know about the immune system”, indicates a person in charge of the agency. Heureusement, XD does not represent that 0.1% of contaminations in week 10 (from 7 to 13 March). Et il ne semble pas avantage s’installer depuis. “Il n’y a pas du tout de signal épidémiologique inquiétant pour l’instant. On l’a suivi car il a vraiment un profil très particulier, mais c’est surtout intéressant en science fundamentale”, note à son propos le responsable de l’unité de génomique evolutive des viruses à RNA à l’Institut Pasteur, Etienne Simon-Lorière, cited by Le Parisien.
From l’autre côté de la Manche, XE questions
Like XD, the XF souche is also a savant mélange between the Delta and Omicron variants. Elle n’a pas été repérée en France, mais au Royaume-Uni, où le séquençage reste très actif. Néanmoins, seouls 38 cases ont été identifiés, et plus aucun depuis la mi-fevrier.
Sur place, c’est plutôt le baptisé XE – recombinant de BA.1 et BA.2 de la famille Omicron – que fait l’objet d’un peu plus d’attention. Au 5 avril, quelque 1 179 sequences de cette souche avaient été analysées. Published on April 8, a British study estimates that there are 20.9% croissance rates in the course of the first three weeks of March. Ces données rest toutefois à confirmer, et ne présagent en rien la capacité de XE à supplanter le variant BA.2 dont il est finalement très proche.
On ne sait enfin que peu de choses sur les souches XG, XH, XJ, XK, repérées sporadiquement en Europe, ou même XL, en Corée du Sud, also XN, XP et XQ, si ce n’est leur composition.
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Au contraire, on sait avec certitude que le Covid-19 réserve encore quelques surprises. « Les expériences de laboratoire suggèrent que le virus porte les noms de solutions d’augmentation capables de contagiosité en modifiant le pic protéique. Et il y a bien d’autres mutations possibles sur différentes parties du virus », précise Bruno Canard à L’express. Et plus le virus continue de circuler, plus les trouvailles de combinaisons.
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