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Fin décembre, une étude des Centers for Disease Control and Prevention (CDC, États-Unis) suggérait que la période d’incubation de l’Omicron serait plus courte que celle des autres variantes. Avec la souche parentale de Sars-CoV-2, les hôtes ont généralement développé des symptômes six à sept jours après l’infection en moyenne, voire jusqu’à quatorze jours plus exceptionnellement. Le délai d’apparition des symptômes avait déjà diminué avec Delta et était plutôt de quatre ou cinq jours. Avec Omicron, l’apparition des symptômes se fait désormais en moyenne deux à trois jours après l’infection, précise le CDC. Si la cause n’est pas clairement établie, deux hypothèses peuvent l’expliquer : soit il s’agit d’une propriété intrinsèque d’Omicron -car il est capable d’attaquer nos cellules plus rapidement- soit le système immunitaire des personnes déjà vaccinées ou infectées réagit plus rapidement . infection et donc produire des symptômes plus tôt qu’auparavant.

Le 5 janvier, une étude japonaise s’est cette fois penchée sur la charge virale des personnes infectées par Omicron. Selon ces travaux, le pic de charge virale – la période pendant laquelle l’hôte est initialement le plus contagieux – survient en moyenne entre trois et six jours après le début des symptômes. Avec Delta, le pic se situait plutôt entre deux jours avant et deux jours après l’apparition des symptômes. Si ces travaux préliminaires doivent être confirmés par d’autres études, ils soulèvent des questions sur la règle d’isolement des personnes positives, mais aussi sur les règles concernant le moment opportun pour réaliser des tests antigéniques et des autotests pour les cas contacts.

Que dit l’étude japonaise ?

Les chercheurs ont étudié 21 patients infectés par Omicron : 19 étaient vaccinés, deux ne l’étaient pas, 17 étaient asymptomatiques et quatre étaient symptomatiques. Les résultats indiquent que la charge virale des personnes symptomatiques, surveillée par des tests PCR, est particulièrement élevée un à neuf jours après le début des symptômes. Le pic se situe entre trois et six jours. Ce n’est qu’à partir du dixième jour que la charge virale diminue significativement.

La charge virale reste élevée pendant un à neuf jours après le début des symptômes et culmine entre trois et six jours.

Recherche épidémiologique active sur l’infection par le SRAS-CoV-2 causée par la variante Omicron au Japon

Pour affiner leurs résultats, les chercheurs ont également cultivé les différents échantillons en laboratoire. En fait, les tests PCR peuvent être positifs lorsque les échantillons ne contiennent que des fragments de virus morts. Leurs résultats ont confirmé les valeurs des tests PCR : le virus était non seulement présent, mais vivant jusqu’à neuf jours après l’apparition des symptômes. En d’autres termes, certains patients étaient encore contagieux neuf jours après le début des symptômes.

Ces résultats confirment notamment les analyses de l’épidémiologiste et professeur à l’université Harvard Michael Mina, qui estime que les personnes infectées par Omicron présentent des symptômes plus rapidement qu’avant, mais aussi que le pic de contagion Omicron survient après les symptômes, un changement différent de ce qui a été observé avec Delta. , Alpha et la souche historique. Le travail japonais confirme également une étude taïwanaise menée par l’Epidemic Central Command Center, l’équivalent taïwanais du CDC américain. Dans ce travail, les chercheurs ont suivi 23 personnes infectées par l’Omicron. Ils ont évalué la charge virale des patients à partir du jour où ils ont développé des symptômes ou du jour où ils ont été testés positifs pour la première fois, ce qui peut expliquer certaines différences par rapport aux résultats de l’étude japonaise. Quoi qu’il en soit, les auteurs disent que tous les patients avaient encore une charge virale élevée et étaient donc probablement encore contagieux, huit jours après l’infection ou le début des symptômes. 26% d’entre eux avaient encore une charge virale élevée entre J+9 et J+12.

Quelles sont ses limites ?

« L’étude japonaise est sérieuse », estime Mahmoud Zureik, professeur d’épidémiologie et de santé publique à l’Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines et co-fondateur du Collectif Du Côté de la Science, en s’appuyant sur un petit nombre de participants , par conséquent, les résultats doivent être confirmés par un travail plus approfondi. « L’étude japonaise contient également quelques inexactitudes, puisque les chercheurs n’indiquent pas la nature des symptômes qu’ils ont pris en compte pour établir le « temps zéro », ni leur durée. , les symptômes d’Omicron sont différents de ceux des autres variantes. La perte de l’odorat et du goût est beaucoup moins signalée, tandis que les problèmes d’estomac, l’écoulement nasal, la toux, les maux de gorge et les maux de tête, la transpiration, la fatigue et les douleurs musculaires semblent être courants. L’étude n’indique pas non plus si le pic de charge virale est sur le troisième, quatrième, cinquième ou sixième jour.

« Il faut aussi noter que des chercheurs japonais étudient la charge virale, mais il ne faut pas forcément tirer de conclusions sur la contagiosité », ajoute Mahmoud Zureik. Ils indiquent que le pic survient entre trois et six jours après les symptômes, ce qui ne veut pas forcément dire que la personne n’est pas contagieuse avant ces trois jours, d’autant plus que l’on sait qu’Omicron s’attache rapidement et facilement à nos cellules. ils précisent que la charge virale chute au bout de six jours, mais qu’elle est encore importante à J+7, J+8 et J+9. Ce n’est qu’au bout de dix jours que le virus diminue significativement.  »

Qu’est-ce que cela change dans les protocoles actuels ?

Compte tenu des travaux du CDC et des études japonaises et taïwanaises, il apparaît que la période pendant laquelle la charge virale des personnes infectées par Omicron atteint un pic – et donc la période pendant laquelle elles sont les plus contagieuses – se situe entre cinq et neuf jours. après infection. Selon le CDC, l’apparition des symptômes se produit, en moyenne, deux à trois jours après cela ; et selon l’étude japonaise, la charge virale culmine entre trois et six jours après le début des symptômes. Certaines personnes peuvent également avoir une charge virale élevée dès le lendemain de l’apparition des symptômes, d’autres peuvent être contagieuses jusqu’à J+9. En conclusion, une personne infectée par Omicron pourrait être contagieuse entre trois et douze jours après l’infection.

Sur la base de ces résultats, les nouvelles règles d’isolement sont-elles adaptées en France ? Selon les autorités, les personnes positives et non vaccinées doivent s’auto-isoler pendant dix jours et seulement sept si elles obtiennent un test RT-PCR négatif. Ce délai semble suffisant, même s’il pourrait être prolongé de deux jours. Pour les personnes vaccinées et positives, le temps d’isolement est fixé à sept jours, voire à seulement cinq avec un test RT-PCR négatif. Si des études préliminaires semblent indiquer que les personnes vaccinées et pourtant infectées sont contagieuses pendant une durée plus courte, l’isolement pourrait être prolongé de quelques jours. « De plus, 95 % des RT-PCR réalisées cinq jours après la contamination sont toujours positives », précise le Pr. Zureik. Les autorités assument clairement cette période de sept ou dix jours d’isolement pour des raisons sanitaires ET économiques. Mais si l’on risque de laisser passer des personnes potentiellement contagieuses, il est impératif de leur rappeler l’importance de respecter et de renforcer les gestes barrières dans les jours qui suivent.  »

Ministère des Solidarités et de la Santé

Le protocole pour les cas contacts non vaccinés, qui doivent être isolés pendant sept jours puis obtenir un test RT-PCR négatif avant de partir, semble également adéquat. Mais les personnes de contact et vaccinées ne sont pas obligées de s’isoler. Il leur suffit de faire un test d’antigène ou RT-PCR dès qu’ils savent qu’ils sont en contact (J + 0), puis un autotest à J + 2 et J + 4. Cependant, selon les américains, les japonais et les taïwanais études, les cas contacts doivent effectuer un autotest cinq à neuf jours après le dernier contact à risque. Le résultat des études pour expliquer les résultats des personnes obtenant un résultat de l’autotest négatif à J+4 et des résultats positifs qui sont tardifs, uniquement si la potentielle défaillance des tests antigéniques et assortiment des autotests à deteêcter Omicron pourraitout de autotests à deteêcter Omicron pourrait sortir des autotests à détecter Omicron pourrait sortir des autotests à détecter Omicron bet.

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« Le test à J+0 est quasiment inutile, souligne Mahmoud Zureik. Ceux de J+2 et J+4 révèlent éventuellement une positivité, mais l’absence de positivité à J+4 n’indique pas l’absence de contamination. D’autant qu’il semble que les personnes vaccinées, même si elles courent moins de risques d’être infectées que les personnes non vaccinées, semblent plus à risque d’être infectées. [avec Omicron] qu’avec les autres variantes. Combien de personnes ont vraiment compris le protocole actuel de toute façon ? Et parmi ceux qui l’ont compris, combien l’appliquent correctement ? « Et s’il fallait simplifier et recommander un seul test après avoir eu contact ? L’idéal serait de s’isoler et de faire un test en J+7″, estime le spécialiste.

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